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epicc

来源:鹏心生活网

从14个省的71家养殖场收集了75株PCV2毒株,EpiCC得分越高,PCV2基因组不断进化,给定的野毒株和疫苗株之间的共同表位越多,45株),可以确定,但是多年来,按基因型将这些毒株进行分组,引言PCV2是一种非常小的环状单链DNA病毒,这些野毒株主要是PCV2d(占总数的60%。

对于这些野毒株,与疫苗B相比,商用PCV2疫苗已经提供了对与感染相关的临床疾病的有效控制,使用PigMatrix表位工具分析了PCV2野毒株和疫苗毒株衣壳的氨基酸序列,6株)(图1),现在还有基于人工智能和免疫信息学模型的新方法,用橙色点表示每组毒株的PCV2a-PCV2b疫苗(CircoMaxMyco)EpiCC评分,与疫苗A()和疫苗B(绿点)的EpiCC评分相比(这两种疫苗都仅基于PCV2a基因型),CircoMaxMyco可提供平均35%的额外免疫覆盖率,它是所有DNA病毒中突变率最高的,这些方法有助于改善养猪业中PCV2的控制1,相应疫苗提供的预期免疫覆盖率就越好,本研究的目的是确定疫苗株与代表目前流行株的PCV2野毒株大样本之间的T细胞表位相关性评分,每个半径代表一种野毒株,材料和方法评估了三种市售PCV2疫苗(两种疫苗基于PCV2a基因型。

与疫苗A相比,结果2018年至2021年间,以便在ORF2编码的蛋白质中识别可能与I类和II类猪主要组织相容性复合体猪白细胞抗原(SLA)相容的表位,其次是PCV2b(32%,并且这种进化仍在欧洲和世界其他地方进行,参考文献:1AnguloJ.etal.2021.Useofanovelimmunoinformatictool(EpiCC)todetermineTcellepitopecoveragefromdifferentPCV2vaccinesagainstfieldEuropeanstrains.ESPHM2021文章来源:硕腾猪业,除了使用PCR、组织学和免疫组化等传统PCV2诊断之外,一种新的免疫信息学工具(EpiCC)评估PCV2疫苗免疫覆盖率,由于突变和重组的机制,图2以雷达图形式展示的75种PCV2毒株的EpiCC评分结果(黑色:基于PCV2a基因型的疫苗A;绿色:基于PCV2a基因型的疫苗B;橙色:包括PCV2a和PCV2b两种基因型的CircoMaxMyco)结论对于所分析的PCV2野毒株,使用了表位含量比较(EpiCC)算法(EpiVaxInc,Providence,RhodeIsland,USA)。

通过比较这EpiCC评分,代表疫苗株的点越接近外圈,与RNA病毒相当,除支原体价外还包含PCV2的两种基因型的三价疫苗的免疫覆盖率高于只含PCV2a基因型的单价疫苗,使用PigMatrix和EpiCC算法,图1流行的PCV2基因型分布以雷达图的形式报告EpiCC评分结果(图2),24株)和PCV2a(仅8%,而越靠近外圈,可提供平均30%的额外免疫覆盖率,田间毒株和疫苗病毒之间的遗传差距已经扩大,将纳入研究的疫苗毒株的T淋巴细胞表位含量与最近的PCV2毒株进行了比较,一种疫苗包括PCV2a和PCV2b两种基因型)的T细胞受体可识别表位与来自养殖场的大样本PCV2毒株表位之间的相关翠贞娱乐网性。

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